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基因数据处理70之Picard安装没成功
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：172
1.下载： https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装： hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK[详细]
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OBIEE RPD开发
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：107
A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrenc[详细]
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推荐 | 9个最佳的大数据处理编程语言
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：195
副标题#e# 大数据的浪潮仍在继续。它渗透到了几乎所有的行业，信息像洪水一样地席卷企业，使得软件越发庞然大物，比如Excel看上去就变得越来越笨拙。数据处理不再无足轻重，并且对精密分析和强大又实时处理的需要变得前所未有的巨大。 那么，在巨大的数据集[详细]
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基因数据处理36之qc-metrics安装
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：75
副标题#e# 更多代码请见：https://github.com/xubo245/SparkLearning Spark中组件Mllib的学习之基础概念篇 1解释 Read and variant metrics,useable for pipeline quality control purposes qc-metrics主要是用于read和变异的度量，流水线质量控制的目的 2.[详细]
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基因数据处理34之使用samtools和bcftools进行变异分析
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：67
1.指令： （1） samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20.fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058.sorted.bam NA12878_snp_A2G_chr20_225058.variants 或者： samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20.fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225[详细]
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推荐系统技术 --- 文本相似性计算（二）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：65
副标题#e# 第一篇地址：推荐系统技术之文本相似性计算（一）上一篇中我们的小明已经中学毕业了，今天这一篇继续文本相似性的计算。首先前一篇不能解决的问题是因为我们只是机械的计算了词的向量，并没有任何上下文的关系，所以思想还停留在机器层面，还没有[详细]
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基因数据处理35之使用samtools和bcftools进行变异分析2--连续处
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：196
指令： samtools mpileup -uf Homo_sapiens_assembly19chr20.fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer.sorted.bam | bcftools call -mv NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer.raw.vcf bcftools filter -s LowQual -e '%QUAL20 || DP100' NA12878_snp_A2[详细]
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基因数据处理37之bdg-formats编译成功
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：109
更多代码请见：https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 bdg-formats是在spark平台上用avro定义的基因处理的数据格式，包括read、sam、vcf、databaseannotion在云平台上的格式，主要用于Adam系统中 2.代码： 【2】下载 编译： mvn clean package -D[详细]
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《hadoop进阶》PeopleRank从社交关系中挖掘价值用户
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：125
副标题#e# 转载请注明出处： 转载自? Thinkgamer的CSDN博客： blog.csdn.net/gamer_gyt 代码下载地址：点击查看 1：PageRank 与 PeopleRank 2：需求分析：挖掘CSDN博客的价值用户 3：算法模型：PeopleRank算法 4：架构设计：从数据准备到PR算法的MR化 5：程[详细]
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XTU 1247 Robb#39;s Problem
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：146
思路：大数处理，可以用二维数组，也可以用Java的BigInteger来处理。我用的是Java，因为方便、快捷。 AC代码如下： import java.util.*;import java.math.*;public class Main{ final static int MAXN = 1005; public static void main(String args[]){ Sc[详细]
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基因数据处理38之dbSnpId到omimId的映射表
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：78
1.下载： 首先收到【2】，来源是【2】 【1】中有描述： You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim of interest ([详细]
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基因数据处理26之avocado运行snap-basic有问题
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：78
hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs2.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527NUMhs2snap /home/hadoop/xubo/data/testTools/se/snap-basic.propertiesUsing SPARK_SUBMIT=/home/hadoop/cloud/spark[详细]
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工具 | R高效数据处理包dplyr和data.table，你选哪个？
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：103
副标题#e# dplyr和data.table是R的两个高效数据处理包，这两个包有它们各自的优点。dplyr包的语法更加优雅，提供了更易于人类所能理解的自然语言。data.table包的语法简洁，并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地，data.table在某些情况下执行效率[详细]
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如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：135
副标题#e# 中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机，掘得富矿？中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称：数博会)上发表致辞时，为此描绘出四大清晰路径。 路径[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：156
副标题#e# （点击上方公众号，可快速关注） 英文：Anna Nicolauo 译者：伯乐在线 - 胡波 链接：http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长，大数据渗透到了各行各业，广泛应用于公司中，同时也使得传统的软件比[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：78
需要注意的是如果使用avocado的命令行，fs和fq为hdfs路径，properties为本地路径： hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basic[详细]
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WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：130
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘，2月的时候开始研究漏洞挖掘技术，2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常，然后就对这个异常如获至宝的分[详细]
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520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：163
副标题#e# 2016年5月20日周五下午，由上海市大数据联盟牵头，慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办，来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之[详细]
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基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：105
读入的read为： val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果： cleanedReads.count:1{"readNum": 0,"contig": {"contigName": "chrUn_KN707963v1_decoy","contigLength": 62955,"contigMD5": null,"referenceURL": null,"assembly": null,"species": nul[详细]
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基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：199
副标题#e# 主要是需要数据正确，如果中间缺少记录，avocado一般不会成功 1.代码： Avocado修改： /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for[详细]
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基因数据处理30之avocado运行avocado-cli中的avocado问题1和2
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：57
问题1： avocado中的run方法中： println("stats.coverage:" + stats.coverage) 调用的是： lazy val coverage = ComputingCoverage.time { ScoreCoverage(inputDataset) } 然后报错： Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationExceptio[详细]
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数据处理---Spring Batch之实践
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-01 热度：60
副标题#e# 上面介绍了Spring Batch的基本概念和简单的demo项目，显然这些还是不够实际使用的。下面我们来更多的代码实践。 ? ? ? ? 在上面的基础项目上面，我们来更多的修改： ? ? ? ? 不用项目默认的hsql DB，用mysql,让ItemReader,ItemWriter 支持mysql；[详细]
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Pentaho BI Server的启动过程详解（二）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-01 热度：137
时隔好久现在接着上一篇来继续聊一下Pentaho BI Server的启动过程，今天主要讲的就一个类PentahoSystem。 软件版本 Pentaho BIServer 5.0.1-ce 关于PentahoSystem 在上一篇文章里已经介绍过在SolutionContextListener中当应用启动时分调用PentahoSystem的i[详细]
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【最强干货】关于文本挖掘的资料（文献，报告，策略，代码）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-01 热度：117
副标题#e# 查看之前文章请点击右上角 ，关注并且 查看历史消息 所有文章全部分类和整理 ，让您更方便查找阅读。请在页面菜单里查找。 今天没有策略研究推送。 有几篇文章还需再研究一下 好久没有给大家干货啦 今天给大家一些干货福利 文本挖掘方面的资料 文[详细]
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暴力：大数加法
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-01 热度：154
Description The I-number of x is defined to be an integer y,which satisfied the the conditions below: 1. yx; 2. the sum of each digit of y(under base 10) is the multiple of 10; 3. among all integers that satisfy the two conditions above,[详细]
